Как происходит зачет переплат на ЕНС.

День добрый!
УСН 6%
В налоговой на ЕНС есть переплата по УСН за 2023 г., а мне нужно заплатить страховые взносы за 1 кв.2024.
Уведомление на 1/4 суммы страховых взносов за 1 кв. 2024 г. (12375=) подавать нужно, как я понимаю.
Зачет денег произойдет автоматически или мне нужно подать заявление о зачете в счет переплаты?

Не нужно платить фиксы до 09.01.2025, да Вы и физически не сможете это сделать. По ним не надо подавать ни уведомление, ни заявление о зачёте.
Свобода рук полная: можете уменьшить исчисленный аванс УСН на ЛЮБУЮ сумму в пределах 49500, если нет работников.
Хотите - на 1 рубль, хотите - на 20000, хотите - на 49500.

Какую сумму желаете?

Если работаете в конфигурации 1С Бухгалтерия предприятия и обновились до последнего релиза 3.0.151.27, то достаточно пробить вручную выбранную Вами сумму здесь:
i.ibb.co/9ZBZz49/2024-04-13-14-38-47.png