для организаций, которые ведут реестр акционеров самостоятельно.

1. какие можно дать рекомендации по хранению реестра на бумажных /электронных носителях.
2. как уберечь организацию от "человеческого фактора" -от того, что сотрудник, который работает с реестром, может передать кому -либо сведения.
3. Какие из проверяющих органов могут потребовать предъявить реестр для ознакомления

По вопросам 1 и 2: Хранение реестра (в любом виде) лучше доверить тому, кому доверяете, как себе. Некому доверить – храните сами.
Потребовать реестр могут (имеют на это право): сотрудники ФСФР; сотрудники «силовых» ведомств (МВД, ФСБ, Прокуратуры и т.д.) в случае возбуждения уголовного дела.