Можно ли заранее защитить сайт от DDos?

Да, есть вполне понятный комплекс мер и инструментарий который
позволит сделать любое веб-приложение устойчивым к DDoS атакам в разумных пределах.

Поскольку этот вопрос, наверное, слишком техничен для аудитории КЛЕРК.РУ, я просто поставлю ссылку на мою презентацию, посвященную этой теме: http://www.highload.ru/papers2009/12217.html