Там же еще есть пункт 5, который говорит о порядке, устанавливаемом местной администрацией. И она как финансовый орган будет функционально независима от ГРБС. Но если это местный бюджет, то и в этом случае можно найти основания посчитать функциональную независимость отсутствующей, поскольку на местном уровне ОМС тесно связаны между собой.
В любом случае будут профессиональные риски. И если так, то нужно разрабатывать процедуры, сводящие к минимуму такие риски, тогда и глав. бух может этим заниматься, и фин. орган.
Сравните Ваш вопрос с проблемой проверки расходов Счетной палаты РФ. Она - высший орган внешнего ГФК. Однако, и ее расходы необходимо проверять. И кто этим занимается при необходимости? Сотрудники аппарата Гос. Думы РФ, хотя они зависимы от Счетной палаты РФ (поскольку она может проверять их расходы).