Какие есть разъяснения: налоговики стоят на позиции, что НДС подлежит восстановлению в суммах, уплаченных поставщикам по приобретенным материальным ресурсам, как не использованным при производстве товаров, работ, услуг, так и использованным в производстве товаров (работ, услуг), не отгруженных (не выполненных, не оказанных) до перехода на УСН. Однако в пп. 2 п. 3 ст. 170 НК РФ сказано о товарах, работах, услугах, основных средствах, нематериальных активах, то есть незавершенное производство или строительство там не упомянуто. Арбитражная практика тоже неоднозначна. Так, ФАС Московского округа считает, что восстанавливать НДС не нужно (постановление от 05.03.2014 № Ф05-1140/2014).
Подсказка: ориентируйтесь на последнюю «арбитражку» (см. выше) и прямые нормы п. 3 ст. 170 НК РФ.