Спасибо за длинный пассаж.
Так вот, открытый формат как раз и означает, что человек, формирующий данные, несет ответственность и за то, какие программы он использует для своей работы. Даже в тех случаях, когда результат работы этих программ не может быть проанализирован без применения специальных средств.
Некорректная работа программы может являться основанием для регрессного иска (если соответствующих ограничений нет в лицензионном договоре / договоре об оказании услуг), но не для освобождения от ответственности.
Так что рассуждения о том, что сертификация защищает пользователя - это демагогия. Обязательная сертификация кормит чиновников и защищает от конкурентов.
Кстати, вопрос о законности всей этой системы Вы старательно обходите
Хотя по другому поводу Вы высказывались, и с Вашим, не побоюсь этого слова, пафосом трудно не согласиться:
Если они ведутся на заведомо незаконные требования, то они, в некотором смысле, сами не лучше. Злоупотребления часто произрастают именно из-за того, что им позволяют безнаказанно произрастать. Налогоплательщика, который демонстрирует такое виктимное поведение, типа "слово налоговой - закон!", мне не очень-то жаль, сам себе злобный баклан.