На мой взгляд, при закрытии месяца корректировки могут производится только по стоимости, но никак не по количеству. И в принципе, программа всегда была со мной в этом согласна
По крайней мере, я ни разу не видела, чтобы было откорректировано именно количество.
Как вариант, посмотрите следующий момент: у вас случайно нет перевода единиц измерения в документах? Например, на этапе внедрения у нас было такое: списывали какую-нибудь приправу в граммах, а основной единицей измерения выбирали килограммы, в итоге из-за округления терялись данные и частично не закрывалась стоимость (но не количество). Например, в требовании указан расход 2,3г, а когда они переводятся в килограммы, то получается 0,002. В итоге 0,3г теряется. Решение проблемы - установка основной единицей измерения более мелкой единицы, т.е., в моём примере, граммов.